Трубников родился 25 апреля 1944 года в Иркутске. В 1967 году окончил Московский государственный институт международных отношений и поступил на службу во внешнюю разведку. В январе 1992 года дослужился до первого заместителя директора СВР, а с января 1996 года по май 2000 года возглавлял ведомство.
С 2016 года ведомство возглавляет офицер запаса Сергей Нарышкин. Ведомство было создано первым президентом РФ Борисом Ельциным. В декабре 1991 года СВР России провозгласила себя официальной преемницей Первого главного управления КГБ СССР.