Строение, напоминающее японский замок, давно стало одним из самых ярких и узнаваемых символов Сахалина. Здание было построено во времена Карафуто по проекту архитектора Ёсио Кайдзука. По его задумке музей возвели в стиле «тэйкан» (императорская корона).
Вокруг музея был разбит парк, в котором высадили растения, произрастающие на территории региона. Перед зданием вырыли круглый пруд, а за ним соорудили каменную горку.
Кроме того, на территории парка были установлены пушки. С годами коллекция экспонатов под открытым небом пополнилась.
Уже после окончания японской оккупации вход в здание музея украсили две фигуры кома-ину (в переводе — «корейская собака»). Ранее они стояли у входа в храм Гококу-дзиндзя города Тоехара (ныне Южно-Сахалинск).
В музее собраны богатые этнографические, нумизматические, археологические, краеведческие коллекции. Здание является объектом культурного наследия регионального значения и находится под государственной охраной.
Ранее телеканал «ОТВ-Сахалин» посвятил зданию, которое считается самым старым в Южно-Сахалинске, выпуск спецпроекта «Место в истории». А недавно директор краеведческого музея Юрий Алин рассказал в беседе с Sakh.online, как оберегает музейное звание визитной карточки Сахалина.