В рамках экологической миссии специалисты по охране окружающей среды выявили, что численность бурого медведя на нерестилищах — 101 особь, что является средним многолетним показателем. Также зафиксировали численность пушных видов млекопитающих: лисица, заяц-беляк, соболь, ласка. За последние 10 лет стабилизировалась численность соболя, колебания популяций других видов находится в пределах средних значений, как правило, небольшой рост сменяется спадом численности.
В прошлом году на территории встречено 70 видов редких птиц, в том числе с помощью фотоловушек. Учет численности водоплавающих и околоводных видов птиц проводился на стационарных маршрутах во время миграций, на зимовке и во время гнездования. Проведено 37 учетов в заповеднике и заказнике.
При мониторинге редких видов сов — рыбного филина — выявлено 18 размножающихся пар. В трёх точках организована зимняя подкормка и наблюдение за кормовой активностью рыбных филинов. Проверено 57 гнезд, зафиксирован вылет 18 птенцов, окольцовано 7 птенцов.
Многолетние исследования показали, что в 2024 году в заповеднике и его охранных зонах гнездятся шесть пар японского журавля, зафиксированы четыре факта гнездования и шесть подросших птенцов. С 2022 года одна пара журавлей остается зимовать на Кунашире вместе с потомством.
За прошлый год сотрудники заповедника впервые проконтролировали колонии японского баклана, который находится в Красной книге Сахалинской области, и куликов — редких и охотничьих видов — на постоянных наблюдательных пунктах.
При помощи юных исследователей из биологического кружка «Биотоп» (Москва) проведен учет редких представителей пресмыкающихся (3 вида полозов) на стационарных площадках. Собрано много данных о редких видах растений, фенологии, метеорологии, сезонных явлениях в живой и неживой природе. Зарегистрировано 23 новых места произрастания редких видов сосудистых растений.